Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLUP10909 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLUP10909 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms