Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHGAP10645 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHGAP10645 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms