Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms