Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL3A1P02461 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms