Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMTA2O94983 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms