Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP2O75323 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms