Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL41O60662 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms