Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TO15178 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TO15178 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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