Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3BO15066 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms