Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3AO14802 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms