Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE40O14503 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms