Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL9O00512 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL9O00512 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL9O00512 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL9O00512 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms