Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN6O00399 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms