Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms