Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms