Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DXG7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DXG7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms