Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms