Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC182A6NF36 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms