Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP3Q9Y6F1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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