Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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HECTD4Q9Y4D8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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HECTD4Q9Y4D8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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HECTD4Q9Y4D8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HECTD4Q9Y4D8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HECTD4Q9Y4D8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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