Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms