Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M1Q9Y2T2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms