Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms