Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC5Q9UQL6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC5Q9UQL6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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