Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MAPRE3Q9UPY8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms