Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms