Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms