Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms