Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPAQ9P0L0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms