Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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