Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms