Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC4Q9NTJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms