Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms