Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms