Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms