Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPHK2Q9NRA0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPHK2Q9NRA0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms