Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms