Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms