Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms