Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms