Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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