Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms