Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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