Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms