Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms