Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERPUD2Q9BSE4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms