Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms