Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms