Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms