Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms